サイトを立ちあげてみたら

「内容符号化 (Content-Encoding) に問題があります 不正または不明な形式で圧縮されているため、ページを表示できません。

この問題を Web サイトの管理者に報告してください。」

という表示がブラウザに表示されて全くページが表示されなくなった。

次のコードのOptions +FollowSymLinks と　# BEGIN WordPress の間の行に
「WP Super Cache」の何やらのコードが入っていて書き換えられていた。

DirectoryIndex index.html index.php 
〜
Options +FollowSymLinks

【この間に一杯コードが入っていた】

# BEGIN WordPress
〜
# END WordPress

サーバーの問題かと思ったりしたのだが、原因としてはWordPressのプラグインのWP Super Cacheの設定で.haccessが書き換えられていた。
WP Super Cacheの設定項目の「キャッシュファイルの提供に mod_rewrite を利用する。 (推奨)」にチェックを入れると.htaccessに書き込まれる仕組みらしい。

この追加された行を削除したら表示されるようになった。
色々と問題のあるWP Super Cacheの様なのでこの際止めておくことにした。